Структура плавленого кварца является разупорядоченной, что позволяет ионам некоторых газов диффундировать через ее структуру при высоких температурах, среди которых диффузия ионов натрия происходит относительно быстро.
Это свойство плавленого кварца имеет большое значение для пользователей. Например, когда плавленый кварц используется в качестве высокотемпературных контейнеров или диффузионных трубок в полупроводниковой промышленности, полупроводниковые материалы требуют чрезвычайно высокой чистоты. Поэтому огнеупорные материалы, используемые в качестве футеровки печей, которые контактируют с плавленым кварцем, должны пройти высокотемпературную и очистительную обработку заранее, чтобы удалить щелочные примеси, такие как калий и натрий, прежде чем их поместят внутрь плавленого кварца для использования.
При комнатной температуре плавленый кварц можно считать непроницаемым для газов. Даже при высоких температурах (например, 700℃) константы проницаемости некоторых газов очень малы. Следовательно, его можно применять в высокотемпературном и высоковакуумном оборудовании.